Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3FQ13275 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3FQ13275 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms