Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF5Q13243 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRSF5Q13243 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF5Q13243 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF5Q13243 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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