Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1H3Q13133 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1H3Q13133 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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