Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSTF3Q12996 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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