Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXC1Q12948 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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FOXC1Q12948 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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FOXC1Q12948 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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FOXC1Q12948 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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FOXC1Q12948 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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FOXC1Q12948 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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FOXC1Q12948 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXC1Q12948 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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FOXC1Q12948 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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FOXC1Q12948 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXC1Q12948 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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