Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 YEL025CYEL025C 3567 nt4.29□□□□□ -1.72
TY2B-BQ12491 CSR2YPR030W 3366 nt4.29□□□□□ -1.72
TY2B-BQ12491 CLB3YDL155W 1284 nt4.29□□□□□ -1.72
TY2B-BQ12491 WSS1YHR134W 810 nt4.29□□□□□ -1.72
TY2B-BQ12491 YLR374CYLR374C 390 nt4.29□□□□□ -1.72
TY2B-BQ12491 YOR338WYOR338W 1092 nt4.29□□□□□ -1.72
TY2B-BQ12491 KAR4YCL055W 1008 nt4.29□□□□□ -1.72
TY2B-BQ12491 NEW1YPL226W 3591 nt4.29□□□□□ -1.72
TY2B-BQ12491 COM2YER130C 1332 nt4.29□□□□□ -1.72
TY2B-BQ12491 PUG1YER185W 912 nt4.28□□□□□ -1.72
TY2B-BQ12491 UBP1YDL122W 2430 nt4.28□□□□□ -1.72
TY2B-BQ12491 OSH2YDL019C 3852 nt4.28□□□□□ -1.72
TY2B-BQ12491 SDS23YGL056C 1584 nt4.27□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 ARP1YHR129C 1155 nt4.27□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 EMC6YLL014W 327 nt4.27□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 CMD1YBR109C 444 nt4.27□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 YCL023CYCL023C 348 nt4.27□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 RPS13YDR064W 456 nt4.26□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 YDR537CYDR537C 606 nt4.26□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 YAP5YIR018W 738 nt4.26□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 YSH1YLR277C 2340 nt4.26□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 PDR1YGL013C 3207 nt4.26□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 SMA2YML066C 1110 nt4.25□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 RAD17YOR368W 1206 nt4.25□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 MNL1YHR204W 2391 nt4.25□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 SAM37YMR060C 984 nt4.25□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 ATP4YPL078C 735 nt4.25□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 MPC54YOR177C 1395 nt4.24□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 VPS36YLR417W 1701 nt4.24□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 GCD1YOR260W 1737 nt4.24□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 RAM1YDL090C 1296 nt4.24□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt4.23□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt4.23□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt4.23□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt4.23□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt4.23□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt4.23□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 MPS2YGL075C 1164 nt4.22□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt4.22□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 MHO1YJR008W 1017 nt4.22□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 YOR385WYOR385W 873 nt4.22□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 PHM6YDR281C 315 nt4.22□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 TIS11YLR136C 858 nt4.22□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 YLR346CYLR346C 306 nt4.22□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 DDI3YNL335W 678 nt4.22□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 OSW7YFR039C 1533 nt4.22□□□□□ -1.73
TY2B-BQ12491 YRM1YOR172W 2361 nt4.21□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 LNP1YHR192W 837 nt4.21□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 SLP1YOR154W 1764 nt4.21□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 HOS1YPR068C 1413 nt4.2□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 FMP33YJL161W 543 nt4.2□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 ANB1YJR047C 474 nt4.2□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 RPL17AYKL180W 555 nt4.2□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 FZO1YBR179C 2568 nt4.2□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 SAP155YFR040W 3009 nt4.2□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt4.19□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 DAL2YIR029W 1032 nt4.19□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 ASG7YJL170C 630 nt4.19□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 STE11YLR362W 2154 nt4.19□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 PET54YGR222W 882 nt4.19□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 MPC3YGR243W 441 nt4.19□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 YOR186WYOR186W 435 nt4.19□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 STP2YHR006W 1626 nt4.19□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 RTT10YPL183C 3042 nt4.19□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 SCP160YJL080C 3669 nt4.19□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 ROK1YGL171W 1695 nt4.18□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 GIN4YDR507C 3429 nt4.18□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 GSM1YJL103C 1857 nt4.18□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 RPS22AYJL190C 393 nt4.18□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 RHO5YNL180C 996 nt4.18□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 MNT4YNR059W 1743 nt4.18□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 HOS3YPL116W 2094 nt4.18□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 YDR222WYDR222W 1248 nt4.17□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 AST2YER101C 1293 nt4.17□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 THP2YHR167W 786 nt4.17□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 SFH1YLR321C 1281 nt4.17□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 RPL6AYML073C 531 nt4.17□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 GYP7YDL234C 2241 nt4.17□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 SWR1YDR334W 4545 nt4.17□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 RPL13AYDL082W 600 nt4.17□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt4.17□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 SNQ2YDR011W 4506 nt4.17□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 YLR152CYLR152C 1731 nt4.16□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 ARP8YOR141C 2646 nt4.16□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 FMP25YLR077W 1752 nt4.16□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 YJL132WYJL132W 2253 nt4.15□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 TFC4YGR047C 3078 nt4.15□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 MGM101YJR144W 810 nt4.15□□□□□ -1.74
TY2B-BQ12491 PRM15YMR278W 1869 nt4.15□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 APL6YGR261C 2430 nt4.15□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 SEC26YDR238C 2922 nt4.15□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 RTT103YDR289C 1230 nt4.14□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 YML119WYML119W 1074 nt4.14□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 HPC2YBR215W 1878 nt4.14□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 DHH1YDL160C 1521 nt4.14□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 TSR1YDL060W 2367 nt4.14□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 AAD16YFL057C 459 nt4.14□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 YNL108CYNL108C 813 nt4.14□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 SDH3YKL141W 597 nt4.13□□□□□ -1.75
TY2B-BQ12491 RPL13BYMR142C 600 nt4.13□□□□□ -1.75
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