Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 GET1YGL020C 708 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 TAM41YGR046W 1158 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 COA1YIL157C 594 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YET1YKL065C 621 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YMR087WYMR087W 855 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 FCY1YPR062W 477 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 ALT2YDR111C 1524 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 MET3YJR010W 1536 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YHL017WYHL017W 1599 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 SAT4YCR008W 1812 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 MAM33YIL070C 801 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YNL092WYNL092W 1203 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 TMA46YOR091W 1038 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 RTT109YLL002W 1311 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 MDM34YGL219C 1380 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 APE1YKL103C 1545 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 UBP16YPL072W 1500 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 TDA3YHR009C 1572 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 UTP9YHR196W 1728 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 AMA1YGR225W 1782 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 PPM2YOL141W 2088 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 VPS70YJR126C 2436 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 SWF1YDR126W 1011 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 PGM1YKL127W 1713 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YLR050CYLR050C 486 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 PBI2YNL015W 228 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YNL181WYNL181W 1224 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 GCR2YNL199C 1605 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 RPS28AYOR167C 204 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 snR17asnR17a 333 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 CET1YPL228W 1650 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YBR285WYBR285W 435 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 ADF1YCL058W-A 342 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 CCZ1YBR131W 2115 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 SEO1YAL067C 1782 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 RAD28YDR030C 1521 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 CIT1YNR001C 1440 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 SSK22YCR073C 3996 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 GPI19YDR437W 423 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 PIL1YGR086C 1020 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YKT6YKL196C 603 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YAR023CYAR023C 540 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 UPS2YLR168C 693 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YMR141CYMR141C 309 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 RDL2YOR286W 450 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 AFR1YDR085C 1863 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 CTK1YKL139W 1587 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 CLB2YPR119W 1476 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 IOC4YMR044W 1428 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 PTC3YBL056W 1407 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 EDE1YBL047C 4146 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 GAL80YML051W 1308 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 CDC43YGL155W 1131 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 PRE9YGR135W 777 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 CBP4YGR174C 513 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 MRPL9YGR220C 810 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 CCP1YKR066C 1086 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 OCA2YNL056W 594 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 MCK1YNL307C 1128 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YNR005CYNR005C 405 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YJL163CYJL163C 1668 nt5.59□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YHR020WYHR020W 2067 nt5.59□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 THR4YCR053W 1545 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 FMP30YPL103C 1407 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 AIM3YBR108W 2844 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YGL015CYGL015C 393 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YOR392WYOR392W 444 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 HAP4YKL109W 1665 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 JEM1YJL073W 1938 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 RTK1YDL025C 1863 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 XKS1YGR194C 1803 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 UBX2YML013W 1755 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 VBA1YMR088C 1689 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 LYS21YDL131W 1323 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 ALG6YOR002W 1635 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 FAD1YDL045C 921 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YDL187CYDL187C 330 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 MRH1YDR033W 963 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 MRPS28YDR337W 861 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 CHZ1YER030W 462 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 HAC1YFL031W 717 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YJL028WYJL028W 336 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YKL118WYKL118W 312 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 ERP1YAR002C-A 660 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 FPR3YML074C 1236 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 RPL15BYMR121C 615 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 PDX3YBR035C 687 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 MSS18YPR134W 807 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YMR279CYMR279C 1623 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YML133CYML133C 4125 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 HED1YDR014W-A 489 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 PRM8YGL053W 714 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 ARC1YGL105W 1131 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 YIR042CYIR042C 711 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 ASF1YJL115W 840 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 ABM1YJR108W 372 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-DR3Q12441 ENT3YJR125C 1227 nt5.56□□□□□ -1.52
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