Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIPPLY1Q0D2K3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms