Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NIPAL4Q0D2K0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIPAL4Q0D2K0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIPAL4Q0D2K0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms