Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM27E3Q08E93 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM27E3Q08E93 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms