Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf54Q08AI8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms