Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC38A11Q08AI6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC38A11Q08AI6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms