Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4F3Q08477 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYP4F3Q08477 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms