Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP1Q07960 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP1Q07960 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms