Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDE4BQ07343 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4BQ07343 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms