Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EGR3Q06889 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EGR3Q06889 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms