Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	DCS1	YLR270W	1053 nt		4.3	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	IAH1	YOR126C	717 nt		4.3	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	KIP3	YGL216W	2418 nt		4.29	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	BSC1	YDL037C	987 nt		4.29	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	YGL188C	YGL188C	174 nt		4.29	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	IMP3	YHR148W	552 nt		4.29	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	NIT3	YLR351C	876 nt		4.29	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	YMR178W	YMR178W	825 nt		4.29	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	IDI1	YPL117C	867 nt		4.29	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	BMT2	YBR141C	1014 nt		4.29	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	snR37	snR37	386 nt		4.29	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	TDA1	YMR291W	1761 nt		4.29	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	APP1	YNL094W	1764 nt		4.29	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	MCM7	YBR202W	2538 nt		4.29	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	GZF3	YJL110C	1656 nt		4.29	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	GAT2	YMR136W	1683 nt		4.29	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	URC2	YDR520C	2319 nt		4.28	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	UGA3	YDL170W	1587 nt		4.28	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	TDA3	YHR009C	1572 nt		4.28	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	RPS14A	YCR031C	414 nt		4.28	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	YDR336W	YDR336W	945 nt		4.28	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	MTM1	YGR257C	1101 nt		4.28	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	INA17	YPL099C	549 nt		4.28	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	GRX1	YCL035C	333 nt		4.28	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	PMS1	YNL082W	2622 nt		4.28	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	SWP82	YFL049W	1872 nt		4.28	□□□□□ -1.72
MRD1	Q06106	GAL11	YOL051W	3246 nt		4.27	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	SYF1	YDR416W	2580 nt		4.27	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	YPR003C	YPR003C	2265 nt		4.27	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	YER034W	YER034W	558 nt		4.27	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	COX2	Q0250	756 nt		4.27	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	REC104	YHR157W	549 nt		4.27	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	BMT5	YIL096C	1011 nt		4.27	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	LAC1	YKL008C	1257 nt		4.27	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	OAR1	YKL055C	837 nt		4.27	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	PSY3	YLR376C	729 nt		4.27	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	COQ5	YML110C	924 nt		4.27	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	AAH1	YNL141W	1044 nt		4.27	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	PNT1	YOR266W	1272 nt		4.27	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	TAF8	YML114C	1533 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	KEG1	YFR042W	603 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	YGL258W-A	YGL258W-A	234 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	LSM12	YHR121W	564 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	BET1	YIL004C	429 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	AIM26	YKL037W	357 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	TEX1	YNL253W	1269 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	UTP23	YOR004W	765 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	MTC4	YBR255W	2085 nt		4.26	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	KRE5	YOR336W	4098 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	DDI2	YFL061W	678 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	DBP3	YGL078C	1572 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	MMM1	YLL006W	1281 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	CTL1	YMR180C	963 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	DDI3	YNL335W	678 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	GCD1	YOR260W	1737 nt		4.25	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	SIP1	YDR422C	2448 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	RIM4	YHL024W	2142 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	SPB4	YFL002C	1821 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	YDR271C	YDR271C	372 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	FOL2	YGR267C	732 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	ECM34	YHL043W	513 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	RPB3	YIL021W	957 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	ARC15	YIL062C	465 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	YLL047W	YLL047W	384 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	IMP1	YMR150C	573 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	REX4	YOL080C	870 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	YBR255C-A	YBR255C-A	363 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	POF1	YCL047C	777 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	MRH4	YGL064C	1686 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	RPB2	YOR151C	3675 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	MSN4	YKL062W	1893 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	MSA1	YOR066W	1890 nt		4.24	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	FAT1	YBR041W	2010 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	YCL075W	YCL075W	441 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	YER076C	YER076C	909 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	SPI1	YER150W	447 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	IRC9	YJL142C	393 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	EBP2	YKL172W	1284 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	IES3	YLR052W	753 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	YNL144W-A	YNL144W-A	84 nt		4.23	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	RNA14	YMR061W	2034 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	GPI10	YGL142C	1851 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	CDC45	YLR103C	1953 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	TRM1	YDR120C	1713 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	AIM6	YDL237W	1173 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	YDR391C	YDR391C	699 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	SLX8	YER116C	825 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	COS12	YGL263W	1143 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	SSP2	YOR242C	1116 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	YOR314W	YOR314W	330 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	YRM1	YOR172W	2361 nt		4.22	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	KIN3	YAR018C	1308 nt		4.21	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	MNL1	YHR204W	2391 nt		4.21	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	SPS2	YDR522C	1509 nt		4.21	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	KAR5	YMR065W	1515 nt		4.21	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	MGR3	YMR115W	1506 nt		4.21	□□□□□ -1.73
MRD1	Q06106	OKP1	YGR179C	1221 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MRD1	Q06106	MBR1	YKL093W	1020 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MRD1	Q06106	YAL069W	YAL069W	315 nt		4.21	□□□□□ -1.74
MRD1	Q06106	JEN1	YKL217W	1851 nt		4.21	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.3 ms