Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CTDSPL2Q05D32 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTDSPL2Q05D32 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms