Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRKCDQ05655 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKCDQ05655 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms