Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCZQ05513 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCZQ05513 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms