Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSTF1Q05048 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms