Protein–RNA interactions for Protein: Q04304

YMR090W, UPF0659 protein YMR090W, yeast

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR090W	Q04304	VPS21	YOR089C	633 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	MAL12	YGR292W	1755 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	MAL32	YBR299W	1755 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	ENA5	YDR038C	3276 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	SNT1	YCR033W	3681 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	FUN12	YAL035W	3009 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	PCI8	YIL071C	1335 nt		2.68	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	FUN30	YAL019W	3396 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	YGR027W-B	YGR027W-B	5268 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	YLR227W-B	YLR227W-B	5268 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	YPR158C-D	YPR158C-D	5268 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	YIL025C	YIL025C	375 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	SGN1	YIR001C	753 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	OST6	YML019W	999 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	THI22	YPR121W	1719 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	FRE4	YNR060W	2160 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	SEC6	YIL068C	2418 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	KDX1	YKL161C	1302 nt		2.67	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	OTU1	YFL044C	906 nt		2.66	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	YFL051C	YFL051C	483 nt		2.66	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	YPR077C	YPR077C	372 nt		2.66	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	SMI1	YGR229C	1518 nt		2.66	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	FLO1	YAR050W	4614 nt		2.66	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	RPN1	YHR027C	2982 nt		2.66	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	MOT1	YPL082C	5604 nt		2.65	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	OCT1	YKL134C	2319 nt		2.65	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	SPO71	YDR104C	3738 nt		2.65	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	IOC3	YFR013W	2364 nt		2.65	□□□□□ -1.98
YMR090W	Q04304	EXO5	YBR163W	1758 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	YMR317W	YMR317W	3423 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	RTT103	YDR289C	1230 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	APA2	YDR530C	978 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	LST7	YGR057C	729 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	YIL175W	YIL175W	318 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	YJL222W-B	YJL222W-B	138 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	PHD1	YKL043W	1101 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	YKL091C	YKL091C	933 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	HMX1	YLR205C	954 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	UNG1	YML021C	1080 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	HUT1	YPL244C	1020 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	NRP1	YDL167C	2160 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	PRP31	YGR091W	1485 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	POL31	YJR006W	1464 nt		2.65	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	FAR1	YJL157C	2493 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	KAP104	YBR017C	2757 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	YDR149C	YDR149C	708 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	QCR10	YHR001W-A	234 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	RPC37	YKR025W	849 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	MRPL20	YKR085C	588 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	YLR036C	YLR036C	612 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	CPR8	YNR028W	927 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	SIP1	YDR422C	2448 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	CMK1	YFR014C	1341 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	BPT1	YLL015W	4680 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	RRN7	YJL025W	1545 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	MIX14	YDR031W	366 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	ENT5	YDR153C	1236 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	OPY1	YBR129C	987 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	YBR134W	YBR134W	402 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	MRPL37	YBR268W	318 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	MDL1	YLR188W	2088 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	RAD5	YLR032W	3510 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	MAK21	YDR060W	3078 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	YPS6	YIR039C	1614 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	YNR063W	YNR063W	1824 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	DHH1	YDL160C	1521 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	LCB5	YLR260W	2064 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	CHO2	YGR157W	2610 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	DSD1	YGL196W	1287 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	YHI9	YHR029C	885 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	LSM1	YJL124C	519 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	RSF1	YMR030W	1131 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	SEC14	YMR079W	915 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	SAS5	YOR213C	747 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	RPL20B	YOR312C	519 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	APM4	YOL062C	1476 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	SKN7	YHR206W	1869 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	CDC40	YDR364C	1368 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	JJJ1	YNL227C	1773 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	RRM3	YHR031C	2172 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	SOF1	YLL011W	1470 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	YEL032C-A	YEL032C-A	162 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	IMP1	YMR150C	573 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	PRX1	YBL064C	786 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	NAT3	YPR131C	588 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	COM2	YER130C	1332 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	TYR1	YBR166C	1359 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	MET10	YFR030W	3108 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	RIF1	YBR275C	5751 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	ARH1	YDR376W	1482 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	ROM1	YGR070W	3468 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	VMA22	YHR060W	546 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	RPN13	YLR421C	471 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	YMR122W-A	YMR122W-A	255 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	TAF3	YPL011C	1062 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	NIP7	YPL211W	546 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	GYP6	YJL044C	1377 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	ITC1	YGL133W	3795 nt		2.59	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	GSH2	YOL049W	1476 nt		2.59	□□□□□ -1.99
YMR090W	Q04304	SEC7	YDR170C	6030 nt		2.59	□□□□□ -1.99

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.9 ms