Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNFRSF17Q02223 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms