Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BNC1Q01954 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms