Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MS4A2Q01362 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms