Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN7AQ01118 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN7AQ01118 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms