Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPTBN1Q01082 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms