Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSG6Q00889 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSG6Q00889 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms