Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLTCQ00610 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLTCQ00610 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms