Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCL8P80075 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCL8P80075 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL8P80075 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL8P80075 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL8P80075 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL8P80075 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL8P80075 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL8P80075 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL8P80075 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL8P80075 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL8P80075 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL8P80075 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL8P80075 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL8P80075 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL8P80075 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL8P80075 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL8P80075 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL8P80075 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL8P80075 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL8P80075 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL8P80075 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL8P80075 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL8P80075 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL8P80075 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL8P80075 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL8P80075 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL8P80075 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL8P80075 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCL8P80075 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCL8P80075 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL8P80075 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL8P80075 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL8P80075 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL8P80075 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL8P80075 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL8P80075 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL8P80075 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCL8P80075 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCL8P80075 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCL8P80075 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCL8P80075 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCL8P80075 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCL8P80075 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CCL8P80075 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL8P80075 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL8P80075 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL8P80075 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL8P80075 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL8P80075 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL8P80075 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL8P80075 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL8P80075 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms