Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX5P78411 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX5P78411 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX5P78411 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX5P78411 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX5P78411 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX5P78411 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX5P78411 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX5P78411 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IRX5P78411 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IRX5P78411 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX5P78411 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX5P78411 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX5P78411 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX5P78411 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX5P78411 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX5P78411 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX5P78411 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX5P78411 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX5P78411 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX5P78411 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX5P78411 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX5P78411 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX5P78411 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX5P78411 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX5P78411 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX5P78411 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX5P78411 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX5P78411 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX5P78411 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX5P78411 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX5P78411 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX5P78411 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX5P78411 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX5P78411 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX5P78411 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX5P78411 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX5P78411 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX5P78411 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX5P78411 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX5P78411 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX5P78411 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX5P78411 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX5P78411 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX5P78411 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX5P78411 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX5P78411 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX5P78411 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX5P78411 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX5P78411 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX5P78411 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX5P78411 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms