Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNA1P78396 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms