Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2P78314 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SH3BP2P78314 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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