Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL30P62888 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL30P62888 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL30P62888 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL30P62888 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL30P62888 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL30P62888 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL30P62888 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL30P62888 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL30P62888 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL30P62888 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL30P62888 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL30P62888 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL30P62888 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL30P62888 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL30P62888 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL30P62888 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL30P62888 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL30P62888 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL30P62888 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms