Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP46P62068 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP46P62068 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP46P62068 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP46P62068 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP46P62068 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP46P62068 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP46P62068 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP46P62068 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP46P62068 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP46P62068 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP46P62068 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP46P62068 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP46P62068 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP46P62068 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP46P62068 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP46P62068 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP46P62068 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP46P62068 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP46P62068 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP46P62068 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP46P62068 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP46P62068 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP46P62068 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP46P62068 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP46P62068 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP46P62068 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP46P62068 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP46P62068 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP46P62068 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP46P62068 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP46P62068 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP46P62068 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP46P62068 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP46P62068 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP46P62068 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP46P62068 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP46P62068 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP46P62068 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP46P62068 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP46P62068 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP46P62068 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP46P62068 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USP46P62068 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP46P62068 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP46P62068 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP46P62068 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP46P62068 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP46P62068 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP46P62068 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP46P62068 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP46P62068 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP46P62068 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP46P62068 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP46P62068 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP46P62068 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP46P62068 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP46P62068 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP46P62068 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP46P62068 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP46P62068 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP46P62068 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP46P62068 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP46P62068 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP46P62068 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP46P62068 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP46P62068 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP46P62068 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP46P62068 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP46P62068 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP46P62068 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP46P62068 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP46P62068 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP46P62068 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP46P62068 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP46P62068 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP46P62068 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP46P62068 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP46P62068 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP46P62068 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP46P62068 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP46P62068 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP46P62068 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP46P62068 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP46P62068 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP46P62068 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP46P62068 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP46P62068 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP46P62068 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP46P62068 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP46P62068 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP46P62068 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP46P62068 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP46P62068 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP46P62068 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP46P62068 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP46P62068 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP46P62068 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP46P62068 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP46P62068 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms