Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOAP61586 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOAP61586 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOAP61586 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOAP61586 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOAP61586 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOAP61586 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOAP61586 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOAP61586 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOAP61586 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOAP61586 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOAP61586 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOAP61586 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOAP61586 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOAP61586 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOAP61586 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOAP61586 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOAP61586 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOAP61586 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOAP61586 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOAP61586 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOAP61586 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOAP61586 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOAP61586 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOAP61586 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOAP61586 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOAP61586 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOAP61586 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOAP61586 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOAP61586 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOAP61586 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOAP61586 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOAP61586 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOAP61586 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOAP61586 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOAP61586 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOAP61586 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOAP61586 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOAP61586 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOAP61586 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOAP61586 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOAP61586 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOAP61586 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOAP61586 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOAP61586 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOAP61586 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOAP61586 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOAP61586 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOAP61586 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOAP61586 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOAP61586 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOAP61586 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOAP61586 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOAP61586 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOAP61586 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOAP61586 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOAP61586 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOAP61586 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RHOAP61586 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOAP61586 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOAP61586 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RHOAP61586 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOAP61586 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOAP61586 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms