Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVS71-1P61550 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVS71-1P61550 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms