Protein–RNA interactions for Protein: P58743

SLC26A5, Prestin, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A5P58743 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC26A5P58743 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC26A5P58743 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC26A5P58743 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC26A5P58743 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC26A5P58743 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC26A5P58743 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC26A5P58743 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC26A5P58743 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC26A5P58743 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC26A5P58743 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC26A5P58743 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC26A5P58743 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC26A5P58743 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC26A5P58743 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms