Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP4P57796 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP4P57796 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP4P57796 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP4P57796 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP4P57796 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP4P57796 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP4P57796 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP4P57796 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CABP4P57796 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP4P57796 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP4P57796 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP4P57796 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP4P57796 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP4P57796 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP4P57796 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP4P57796 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP4P57796 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP4P57796 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP4P57796 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP4P57796 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP4P57796 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP4P57796 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP4P57796 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP4P57796 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP4P57796 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP4P57796 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP4P57796 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP4P57796 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP4P57796 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP4P57796 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP4P57796 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP4P57796 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP4P57796 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP4P57796 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP4P57796 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP4P57796 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP4P57796 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP4P57796 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP4P57796 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP4P57796 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP4P57796 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP4P57796 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP4P57796 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP4P57796 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP4P57796 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP4P57796 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP4P57796 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP4P57796 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP4P57796 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP4P57796 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP4P57796 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP4P57796 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP4P57796 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP4P57796 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP4P57796 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CABP4P57796 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CABP4P57796 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP4P57796 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP4P57796 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP4P57796 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP4P57796 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP4P57796 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP4P57796 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP4P57796 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP4P57796 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP4P57796 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP4P57796 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CABP4P57796 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP4P57796 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP4P57796 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP4P57796 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP4P57796 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP4P57796 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP4P57796 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP4P57796 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP4P57796 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP4P57796 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP4P57796 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CABP4P57796 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP4P57796 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP4P57796 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP4P57796 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP4P57796 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP4P57796 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP4P57796 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP4P57796 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP4P57796 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP4P57796 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP4P57796 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CABP4P57796 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP4P57796 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP4P57796 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP4P57796 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP4P57796 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP4P57796 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP4P57796 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP4P57796 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CABP4P57796 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP4P57796 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms