Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX16P57768 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX16P57768 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX16P57768 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX16P57768 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX16P57768 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX16P57768 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX16P57768 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX16P57768 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX16P57768 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX16P57768 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX16P57768 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX16P57768 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX16P57768 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX16P57768 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX16P57768 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX16P57768 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX16P57768 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX16P57768 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX16P57768 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX16P57768 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX16P57768 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX16P57768 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX16P57768 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX16P57768 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX16P57768 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX16P57768 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX16P57768 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX16P57768 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX16P57768 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX16P57768 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX16P57768 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX16P57768 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX16P57768 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX16P57768 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX16P57768 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX16P57768 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX16P57768 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX16P57768 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX16P57768 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX16P57768 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX16P57768 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX16P57768 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX16P57768 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX16P57768 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX16P57768 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX16P57768 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX16P57768 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX16P57768 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX16P57768 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX16P57768 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX16P57768 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX16P57768 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX16P57768 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX16P57768 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX16P57768 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX16P57768 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX16P57768 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX16P57768 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX16P57768 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX16P57768 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX16P57768 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX16P57768 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX16P57768 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX16P57768 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX16P57768 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX16P57768 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX16P57768 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX16P57768 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX16P57768 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX16P57768 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX16P57768 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX16P57768 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX16P57768 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX16P57768 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX16P57768 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX16P57768 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX16P57768 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX16P57768 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX16P57768 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms