Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX4P57082 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX4P57082 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX4P57082 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX4P57082 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX4P57082 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX4P57082 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBX4P57082 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBX4P57082 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBX4P57082 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBX4P57082 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TBX4P57082 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TBX4P57082 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBX4P57082 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBX4P57082 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBX4P57082 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBX4P57082 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX4P57082 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX4P57082 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX4P57082 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX4P57082 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX4P57082 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX4P57082 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX4P57082 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX4P57082 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX4P57082 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX4P57082 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX4P57082 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX4P57082 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX4P57082 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBX4P57082 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TBX4P57082 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TBX4P57082 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TBX4P57082 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TBX4P57082 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TBX4P57082 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TBX4P57082 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TBX4P57082 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TBX4P57082 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TBX4P57082 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBX4P57082 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBX4P57082 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBX4P57082 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBX4P57082 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBX4P57082 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBX4P57082 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBX4P57082 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBX4P57082 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TBX4P57082 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBX4P57082 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TBX4P57082 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TBX4P57082 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBX4P57082 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBX4P57082 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBX4P57082 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBX4P57082 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBX4P57082 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBX4P57082 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBX4P57082 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBX4P57082 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TBX4P57082 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX4P57082 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX4P57082 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX4P57082 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX4P57082 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX4P57082 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX4P57082 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX4P57082 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX4P57082 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX4P57082 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX4P57082 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX4P57082 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX4P57082 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX4P57082 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX4P57082 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX4P57082 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX4P57082 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX4P57082 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX4P57082 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX4P57082 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX4P57082 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX4P57082 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX4P57082 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms