Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME5P56597 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NME5P56597 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME5P56597 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NME5P56597 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME5P56597 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME5P56597 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME5P56597 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME5P56597 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME5P56597 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NME5P56597 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NME5P56597 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NME5P56597 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NME5P56597 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME5P56597 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME5P56597 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME5P56597 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME5P56597 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME5P56597 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME5P56597 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME5P56597 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME5P56597 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME5P56597 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME5P56597 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME5P56597 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME5P56597 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NME5P56597 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME5P56597 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME5P56597 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME5P56597 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME5P56597 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME5P56597 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME5P56597 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME5P56597 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NME5P56597 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME5P56597 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME5P56597 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME5P56597 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME5P56597 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME5P56597 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME5P56597 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NME5P56597 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME5P56597 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME5P56597 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME5P56597 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME5P56597 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME5P56597 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME5P56597 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME5P56597 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME5P56597 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME5P56597 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME5P56597 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME5P56597 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME5P56597 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME5P56597 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME5P56597 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME5P56597 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME5P56597 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME5P56597 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME5P56597 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME5P56597 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NME5P56597 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME5P56597 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME5P56597 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME5P56597 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NME5P56597 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME5P56597 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME5P56597 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME5P56597 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME5P56597 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME5P56597 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME5P56597 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME5P56597 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME5P56597 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME5P56597 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME5P56597 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME5P56597 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME5P56597 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME5P56597 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME5P56597 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NME5P56597 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME5P56597 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME5P56597 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME5P56597 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms