Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH8P55286 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH8P55286 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH8P55286 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH8P55286 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH8P55286 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH8P55286 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH8P55286 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH8P55286 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH8P55286 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH8P55286 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH8P55286 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH8P55286 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH8P55286 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH8P55286 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH8P55286 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH8P55286 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH8P55286 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH8P55286 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH8P55286 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH8P55286 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH8P55286 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH8P55286 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH8P55286 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH8P55286 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH8P55286 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH8P55286 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH8P55286 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH8P55286 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH8P55286 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH8P55286 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH8P55286 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH8P55286 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH8P55286 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH8P55286 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH8P55286 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH8P55286 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH8P55286 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH8P55286 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH8P55286 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH8P55286 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH8P55286 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH8P55286 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH8P55286 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH8P55286 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH8P55286 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH8P55286 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH8P55286 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH8P55286 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH8P55286 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH8P55286 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH8P55286 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH8P55286 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH8P55286 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH8P55286 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH8P55286 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH8P55286 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH8P55286 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH8P55286 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH8P55286 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH8P55286 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH8P55286 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH8P55286 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH8P55286 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH8P55286 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH8P55286 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH8P55286 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH8P55286 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH8P55286 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH8P55286 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH8P55286 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH8P55286 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH8P55286 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH8P55286 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH8P55286 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH8P55286 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH8P55286 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH8P55286 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH8P55286 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms