Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP9P55211 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP9P55211 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP9P55211 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP9P55211 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP9P55211 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP9P55211 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP9P55211 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP9P55211 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP9P55211 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP9P55211 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP9P55211 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP9P55211 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP9P55211 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP9P55211 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP9P55211 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP9P55211 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP9P55211 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP9P55211 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASP9P55211 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASP9P55211 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP9P55211 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP9P55211 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP9P55211 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP9P55211 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP9P55211 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP9P55211 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP9P55211 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP9P55211 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASP9P55211 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP9P55211 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP9P55211 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP9P55211 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP9P55211 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP9P55211 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP9P55211 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP9P55211 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP9P55211 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP9P55211 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP9P55211 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP9P55211 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP9P55211 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP9P55211 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms