Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAP1L1P55209 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms