Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHBP55084 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHBP55084 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHBP55084 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHBP55084 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHBP55084 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHBP55084 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHBP55084 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHBP55084 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHBP55084 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHBP55084 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHBP55084 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHBP55084 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHBP55084 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHBP55084 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHBP55084 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHBP55084 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHBP55084 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHBP55084 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHBP55084 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHBP55084 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHBP55084 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHBP55084 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHBP55084 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHBP55084 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHBP55084 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHBP55084 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HADHBP55084 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HADHBP55084 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HADHBP55084 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HADHBP55084 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HADHBP55084 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HADHBP55084 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHBP55084 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHBP55084 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHBP55084 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHBP55084 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHBP55084 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHBP55084 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHBP55084 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHBP55084 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHBP55084 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHBP55084 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHBP55084 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHBP55084 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHBP55084 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHBP55084 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHBP55084 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHBP55084 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHBP55084 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHBP55084 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHBP55084 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHBP55084 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHBP55084 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHBP55084 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHBP55084 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHBP55084 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHBP55084 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHBP55084 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms