Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKAA2P54646 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAA2P54646 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAA2P54646 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAA2P54646 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA2P54646 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA2P54646 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA2P54646 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA2P54646 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKAA2P54646 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms