Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
YARSP54577 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YARSP54577 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YARSP54577 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YARSP54577 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YARSP54577 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YARSP54577 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YARSP54577 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YARSP54577 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YARSP54577 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YARSP54577 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YARSP54577 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YARSP54577 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YARSP54577 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YARSP54577 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
YARSP54577 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YARSP54577 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YARSP54577 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YARSP54577 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YARSP54577 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YARSP54577 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YARSP54577 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YARSP54577 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YARSP54577 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
YARSP54577 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YARSP54577 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
YARSP54577 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
YARSP54577 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
YARSP54577 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YARSP54577 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YARSP54577 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
YARSP54577 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YARSP54577 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YARSP54577 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YARSP54577 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YARSP54577 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YARSP54577 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YARSP54577 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YARSP54577 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YARSP54577 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YARSP54577 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YARSP54577 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YARSP54577 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YARSP54577 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YARSP54577 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YARSP54577 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YARSP54577 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YARSP54577 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YARSP54577 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YARSP54577 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YARSP54577 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YARSP54577 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YARSP54577 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YARSP54577 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YARSP54577 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YARSP54577 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YARSP54577 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YARSP54577 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
YARSP54577 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YARSP54577 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YARSP54577 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YARSP54577 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YARSP54577 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YARSP54577 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YARSP54577 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YARSP54577 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YARSP54577 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
YARSP54577 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YARSP54577 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YARSP54577 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
YARSP54577 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YARSP54577 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YARSP54577 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YARSP54577 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
YARSP54577 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YARSP54577 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YARSP54577 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YARSP54577 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YARSP54577 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YARSP54577 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YARSP54577 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms