Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CRISP3P54108 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CRISP3P54108 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms