Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNF138P52744 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF138P52744 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms